Η τελευταία αίθουσα, που εγκαινιάσθηκε στις 31-1-2004, είναι ο «επίλογος» της μόνιμης έκθεσης. Με αυθεντικό αρχαιολογικό υλικό αλλά και με ψηφιακές εφαρμογές παρουσιάζεται η πορεία που ακολουθεί το αρχαίο αντικείμενο από την ανασκαφή, όπου ανακαλύπτεται, στο μουσείο, όπου εκτίθεται, περνώντας από τα ενδιάμεσα στάδια της καταγραφής, της μελέτης και της συντήρησης. Παρουσιάζεται ακόμη η ιστορία των μουσείων μέσω δύο μονάδων υπολογιστών και οθονών αφής και προβάλλεται η μικρού μήκους ταινίας «Μουσείο Βυζαντινού Πολιτισμού. Τοπίο και μνήμες», που παρουσιάζει την ιστορία της περιοχής του Μουσείου διαχρονικά.

Η έκθεση συγχρηματοδοτήθηκε από την Ευρωπαϊκή ‘Ενωση (Γ΄ Κοινοτικό Πλαίσιο Στήριξης, Επιχειρησιακό Πρόγραμμα Πολιτισμός, 2000-2006) και από το Ελληνικό Δημόσιο (Υπουργείο Πολιτισμού).